IMM memiliki lambang berbentuk seperti perisai pena yang berlapis tiga dimana makna dari perisai pena sendiri ialah sebagai orang yang menuntut ilmu dan berlapis tiga yang bermakna sebagai Iman, Islam dan Ikhsan atau Iman, Ilmu dan Amal. Adapula warna yang terdapat pada lambing IMM yaitu Hitam yang artinya kekuatan, ketabahan dan keabadian, Kuning yang artinya kemuliaan, Merah yang artinya keberanian daam berfikir, berbuat
dan bertanggung jawab, Hijau yang artinya kesejahteraan dan Putih yang
artinya Kesucian. Pada lambang IMM terdapat pula gambar sinar matahari sebagai ortom Muhammadiyah, Bunga melati sebagai penerus perjuangan persyarikatan Muhammadiyah dan tulisan Arab “Fastabiqul Khairat” yang artinya berlomba-lombalah dalam kebaikan.